<div dir="ltr">Hi Alfio, <br><br>we I asked my HPC administrator to instal the new cp2k 5.1, they also used <b>easybuild</b>, but they obtained several errors after running the <b>make test. </b>So I installed the cp2k by myself using the toolchain script which will basically do everything. You can find toolchain in the instalation package you download from cp2k repo (cp2k-5.1/tools/toolchain/) - use stable release and not the current trunk. After that I got 0 error in the test results.<br><br>Except MPI and Intel MKL libraries (which I loaded via modules), the toolchain installed all other libraries.<br>So my installation on HPC cluster was like: <br><br>module load MPICH/3.2-GCC-5.3.1-snapshot-20160419-2.25<br>module load imkl/2017.1.132-iimpi-2017a<br>./install_cp2k_toolchain.sh -j 8 --install-all --mpi-mode=mpich --math-mode=mkl --enable-omp=no --with-binutils=system --with-mkl=system --with-gcc=system --with-mpich=system --with-binutils=system  --with-cmake=system<br><br>Best.<br> Jan.<br><br><br>Dne čtvrtek 18. ledna 2018 14:06:19 UTC+1 Alfio Lazzaro napsal(a):<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div>Hello Phil,</div><div>then, I would suggest to ask to your HPC system administrator to test CP2K installation. There is nothing we can do in this forum for you :(</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Alfio</div><div><br></div><br><br>Il giorno mercoledì 17 gennaio 2018 14:43:22 UTC+1, Phil G. ha scritto:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello Alfio,<br><br>thank you for your reply. I think it is a problem with the new module. Our HPC is a slurm-type computer system (HRSK-II) and it has the EasyBuild environment. <br>I use batch-file (*.sh) in order to run the DFT calculation or MD simulation on HPC after submitting input and batch files via WinSCP and PuTTY program (SSH connection with X11 forwarding). <br><br>Kind regards,<br><br>Phil<br><br>Am Dienstag, 16. Januar 2018 14:50:12 UTC+1 schrieb Alfio Lazzaro:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello Phil,<div>I tried your input with CP2K 5.1 compiled with GNU, PSMP version, running with 288 ranks and 1 thread, and I cannot get your message.</div><div>The only difference is that I changed the </div><div><br></div><div><span style="font-family:monospace"><span style="color:rgb(0,0,0)"><     BASIS_SET_FILE_NAME /lustre/scratch2/s2047290/<wbr>2018/LNpos4x4_H2O_MD_201801_1/<wbr>BASIS_MOLOPT </span><br><     POTENTIAL_FILE_NAME /lustre/scratch2/s2047290/<wbr>2018/LNpos4x4_H2O_MD_201801_1/<wbr>POTENTIAL <br>--- <br>>     BASIS_SET_FILE_NAME BASIS_MOLOPT <br>>     POTENTIAL_FILE_NAME POTENTIAL<br>
<br></span></div><div>But I don't think this is the reason for the error...</div><div>Therefore it looks like a problem with your new module 5.1-intel-2017b. However, it is not clear to me where you are getting this module and how it is compiled (is it easybuild? which arch file are you using? which compiler version?).</div><div>I would recommend running the regtest (if you haven't already) to check if the CP2K installation is correct (see <a href="https://www.cp2k.org/dev:regtesting" rel="nofollow" target="_blank" onmousedown="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Fwww.cp2k.org%2Fdev%3Aregtesting\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNG1cOJGd_1hhwVDqInibboNBS5zMw';return true;" onclick="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Fwww.cp2k.org%2Fdev%3Aregtesting\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNG1cOJGd_1hhwVDqInibboNBS5zMw';return true;">https://www.cp2k.org/dev:<wbr>regtesting</a>)</div><div><br></div><div>Alfio</div><div><br></div><div><br>Il giorno lunedì 15 gennaio 2018 16:43:56 UTC+1, Phil G. ha scritto:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear CP2K fans,<br><br>since our HPC gets the new module version of CP2K (5.1-intel-2017b), after submitting the batch file and starting the MD, the simulation was stopped/aborted due to the error message: "Dipole correction needs more vacuum space above the surface"<br>This error does not occur if the MD simulation was run with older module version of CP2K (3.0). Is there a bug in the new module file of CP2K 5.1-intel-2017b ?<br><br>Here the files are attached here.<br><br>Kind regards,<br><br>Phil<br><br> <br></div></blockquote></div></div></blockquote></div></blockquote></div></blockquote></div>