<div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div>I am trying to study the H+ transfer from water to a surface.</div><div>The H+ in solution is present as H3O+ so in principle I have to use one CV </div><div>(CV1) to split/form the H3O+ (H2O ---H+) and a second CV (CV2  to)drive the H+ eventually onto the surface.</div><div>CV1, I could used Coordination Number over KINDS_FROM H,  KINDS_TO O.</div><div>For the second CV I would use the projection along Z axis (perpendicular to the surface) of the H+ atom with respect the surface, maintaining the H+ indistinguiscible.</div><div>It seems to me that this is more or less what the CONDITIONED_DISTANCE do. Nevertheless, I did not understand how actually it works.  Where, can I find  more info about that? </div><div>I understood:</div><div>when  H+ has a coordination number equal to zero ( e.g. KINDS_FROM H,  KINDS_TO O and R0 1.3) the distance between the H+ and an atom at the surface is evaluated and so on.</div><div>ATOMS_DISTANCE: it should be the distance between the delocalized H+ and an atom of the surface. Actually, I would to use the z-projection, somethin like the </div><div>"plane distance CV", but  to grasp the process also only one atom of the surface distance could work. However, if there are not other options, I could try to add z-projection in the code.</div><div><br></div><div>Any advice is greatly appreciated.</div><div><br></div><div>Luca  </div><div><br></div></div>