<div dir="ltr">Hi, <div><br><div>Your 4th question has been solved here: https://groups.google.com/forum/#!searchin/cp2k/QMMM|sort:relevance/cp2k/sAFOLwwiAOM/mcHEF0nqBQAJ.</div><div>And the 5th question, you can consult the paper listed  at the end of *.out file, written by Laino.</div><div><br></div><div>Best wishes !  </div><div><br></div><div><br>在 2017年5月24日星期三 UTC+8下午11:12:32，tuf...@temple.edu写道：<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Hello CP2K Users,<br>Here I am attaching my CP2K input file for the QMMM simulation of alanine in methanol where I am interested in treating the alanine and some methanol molecule in QM region and rest of the methanol as MM. I made this input by taking the help from the cp2k website for urea in water example. In urea water example only urea is treated QM and water as MM. <br>My questions are as follows: <br><br>(1) Is this is the correct input file to start simulations in terms of input parameters?<br><br>(2) if I am using "The Adaptive Buffered Force" from <a href="https://arxiv.org/pdf/1409.5218.pdf" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Farxiv.org%2Fpdf%2F1409.5218.pdf\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNGm4terM2YTxjU7VC85oMfSMz2Hog';return true;" onclick="this.href='https://www.google.com/url?q\x3dhttps%3A%2F%2Farxiv.org%2Fpdf%2F1409.5218.pdf\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNGm4terM2YTxjU7VC85oMfSMz2Hog';return true;">https://arxiv.org/pdf/1409.<wbr>5218.pdf</a> , the simulation is very slow. <br><br>(3) How to deal with the temperature of QM region and total system. Is both should be equal.<br><br>(4) ECOUPL COULOMB or GEEP which one is preferable for this system. <br><br>(5) How to deal with the periodicity of the QM region.<br><br><br>Thanking you<br><br>Regards,<br>Vivek (<a href="http://astro.temple.edu/~tuf65156" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='http://www.google.com/url?q\x3dhttp%3A%2F%2Fastro.temple.edu%2F~tuf65156\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNHdojZ_H86Ne2mCcbRV4ImaOaj6Hw';return true;" onclick="this.href='http://www.google.com/url?q\x3dhttp%3A%2F%2Fastro.temple.edu%2F~tuf65156\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNHdojZ_H86Ne2mCcbRV4ImaOaj6Hw';return true;">http://astro.temple.edu/~<wbr>tuf65156</a>)<br>Temple University.<br></div></blockquote></div></div></div>