<div dir="ltr"><div>Would someone be willing to explain this problem in some more detail? I'd like to convert the last snapshot of my pdb trajectory into a cif file containing fractional coordinates. I was planning to do this using obabel to get the cif file containing Cartesian coordinates, and then using obabel again to get a fractional coordinate file. However, I believe that obabel does the second conversion assuming that crytallographic conventions regarding the unit cell (https://en.wikipedia.org/wiki/Fractional_coordinates#In_Crystallography) are followed, and per this thread, I'm not sure whether this is the case.</div><div><br></div><div>Efrem Braun</div><div><br>On Friday, January 31, 2014 at 4:34:37 PM UTC+1, FX Coudert wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;">> There is now an alternative dump format called DCD_ALIGNED_CELL which dumps the coordinates based on a cell alignment as described which should allow a reconstruction of the scaled coordinates only from the DCD dump data (to single precision accuracy).
<br>
<br>Thanks!
<br>
<br>FX</blockquote></div></div>