<div dir="ltr">Dear experts:<div><br></div><div>I am setting up a qmmm simulation with CP2K. In the setup, I set the QM box to be the same with the whole system box, with periodic boundary condition. The md ensemble is in NVT. The simulations could run, however, the output trajectory was strange.</div><div><br></div><div>1. The whole system is vibrating.</div><div><br></div><div>2. Some atoms are moving out of the periodic box.</div><div><br></div><div>Please see the attached input files. The trajectory file and the output file could be find following the google drive link, and you could see the problems I mentioned above. I would be appreciating any suggestions and feedbacks.<br></div><div><br></div><div>https://drive.google.com/open?id=0B-YkNOdiWhHReDdHOEdwZEhweE0<br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks very much for your help.</div><div><br></div><div>Tao</div></div>