<div dir="ltr"><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div><br></div><div>What information would be best for you (or others) to help me fully address this?</div><div><br></div></div></blockquote><div>Hard to say. </div><div><br></div><div>As I see it, the issue is you say the systems behave differently. But individual MD trajectories are chaotically sensitive to initial conditions, which you get when you swap coordinates. I doubt there is any significant difference between the systems.</div><div><br></div><div>Matt</div><div><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div></div><div>Thanks again, Richard </div><div> </div><div> </div></div></blockquote></div>