<div dir="ltr"><p class="separator" style="text-align: center; clear: both;"><a imageanchor="1" href="https://lh3.googleusercontent.com/-8myL1oT6-vM/WOerqIUHR_I/AAAAAAABLyE/OJS33ed6RzsaqOniyv-E_dsh-T9JLOWtgCLcB/s1600/50-50.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img src="https://lh3.googleusercontent.com/-8myL1oT6-vM/WOerqIUHR_I/AAAAAAABLyE/OJS33ed6RzsaqOniyv-E_dsh-T9JLOWtgCLcB/s320/50-50.png" border="0" width="320" height="275"></a></p>Hi Marcella,<div>I have only a quite big system at hand (inputs attached), I need to hunt for it in a smaller system.</div><div><br></div><div>Here are the PDOSes on the main contributing atoms on molecule 1 and molecule 2:</div><div>Molecule 1</div><div>atom1   13684          0.050947        0.000000        0.00000027        0.00003382        0.00000113</div><div>atom2   13684          0.050947        0.000000        0.00000306        0.00000563        0.00000795<br></div><div><br></div><div>Molecule 2</div><div>atom1   13684          0.050947        0.000000        0.00026744        0.65271139        0.00090897</div><div>atom2   13684          0.050947        0.000000        0.06042569        0.10274557        0.15672435</div><div><br></div><div>and here is the cube:</div><p class="separator" style="text-align: center; clear: both;"><a imageanchor="1" href="https://lh3.googleusercontent.com/-8myL1oT6-vM/WOerqIUHR_I/AAAAAAABLyE/OJS33ed6RzsaqOniyv-E_dsh-T9JLOWtgCLcB/s1600/50-50.png" style="margin-left: 1em; margin-right: 1em;"><img src="https://lh3.googleusercontent.com/-8myL1oT6-vM/WOerqIUHR_I/AAAAAAABLyE/OJS33ed6RzsaqOniyv-E_dsh-T9JLOWtgCLcB/s320/50-50.png" border="0" style="" width="320" height="275"></a></p><div><br><br>On Friday, April 7, 2017 at 8:19:41 AM UTC-4, Marcella Iannuzzi wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Hi Alex, <div><br></div><div>this sounds very strange. Can you please provide the input file, including the coordinates. </div><div>Thanks</div><div>Marcella</div><div><br><br>On Thursday, April 6, 2017 at 5:50:47 PM UTC+2, Alex Vozny wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">I'm having the above issue in one of my calculations:<div>I have two nearly non-interacting molecules</div><div>When I look at the HOMO of the whole system, the PDOS shows that it is fully (say 99%) localized on one molecule</div><div>when I look at the HOMO cube file, it is almost 50/50 delocalized on both.</div><div><br></div><div>Initially I though I was doing something wrong but now I've heard it reconfirmed by other people.</div><div>How do I proceed to bring this to developers' attention and investigation of the origin of the problem?</div><div><br></div><div>Alex</div></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div>