<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div><br></div>for non-periodic systems there should be no problem. The potential drops off as 1/r to a constant which you can define as your vacuum level.<div><br></div><div>You might need a very large box or do some sort of extrapolation for accurate values.</div><div><br></div><div>Matt<br><br>On Thursday, February 2, 2017 at 12:42:06 PM UTC, Nuri Yazdani wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">A quick addition.. One thing I was thinking of doing was to use the energy of the deepest (lowest energy) states from the two calculations as an approximation to the difference in the reference levels. There are 543 occupied molecular orbitals in my system, and the difference in energy from the HOMO to the deepest is 16eV. Would this in general be a reasonable assumption? </div></blockquote></div></div>