<div dir="ltr">Dear prof. Hutter,<div>first of all thanks a lot for the quick reply. </div><div><br></div><div>My system is an organic system. The single molecule is a radical, but I am simulating a bulk system, with 32 molecules. Each molecules is "coupled" with the first neighbor, so that the final result is that I have a neutral system. My system is an insulator. The states are mainly localized in the around of the nitrogen which formally host the unpaired electron. I will provide also an image of the system, so that You can have an idea on how it is.</div><div><br></div><div>The parallelization setup I am using is the following:</div><div><br></div><div>128 processors with 16 processes per node.</div><div><br></div><div>Ok, i will try to use the Jacobi option to see if it able to run run properly, as a first trial. </div><div><br></div><div>Thanks a lot again,</div><div>Best,</div><div>Tommaso</div><div><br></div><div><br><br>Il giorno mercoledì 23 novembre 2016 09:45:36 UTC+1, jgh ha scritto:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;">Hi
<br>
<br>it is impossible to give a final answer to your question without
<br>looking deeper into your system and setup.
<br>Why is your system is so difficult to converge? Is it metallic, or has a small gap?
<br>Has it very delocalized states?
<br>Another reason for the bad timing might be an unfortunate setup for
<br>parallelization. What are you using?
<br>
<br>In any case, I would first try to switch to Jacobi from the start or
<br>reduce the maximum number of iterations to a much smaller number.
<br>
<br>regards
<br>
<br>Juerg  
<br>------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>--
<br>Juerg Hutter                        <wbr> Phone : ++41 44 635 4491
<br>Institut für Chemie C                FAX   : ++41 44 635 6838
<br>Universität Zürich                   E-<wbr>mail: <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">hut...@chem.uzh.ch</a>
<br>Winterthurerstrasse 190
<br>CH-8057 Zürich, Switzerland
<br>------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>---
<br>
<br>-----<a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.com</a> wrote: -----To: cp2k <<a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.com</a>>
<br>From: <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">tfra...@gmail.com</a>
<br>Sent by: <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.com</a>
<br>Date: 11/22/2016 11:41AM
<br>Subject: [CP2K:8422] problem with Wannier block in MD
<br>
<br>Dear all,I am newbie in CP2K code. I am running a MD, and after a 3 ps of equilibration, I added the Wannier block in order to compute the Wannier functions associated with the atomic positions for post processing the corresponding <a href="http://wannier.xyz" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='http://www.google.com/url?q\x3dhttp%3A%2F%2Fwannier.xyz\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNHkvDSht3oOfrSUWzG0emf0h0W26A';return true;" onclick="this.href='http://www.google.com/url?q\x3dhttp%3A%2F%2Fwannier.xyz\x26sa\x3dD\x26sntz\x3d1\x26usg\x3dAFQjCNHkvDSht3oOfrSUWzG0emf0h0W26A';return true;">wannier.xyz</a> output with TRAVIS. I added the Wannier block and at the same time I changed the parameter of the thermostat in order to start the full production. The point is the the time per cycle increase abruptly and honestly I don't know if there are some parameters to tune properly. In the output, also, the CRAZY method does not CONVERGE, and CP2K automatically switches to JACOBI. 
<br>Can someone kindly help me fixing this problem?
<br>Here I provide the input file, the part of the energy file in which the time per cycle increased a lot and the line of the output file.
<br>
<br>
<br>      3970         1985.000000         0.450372996       270.116570530     -2373.094227635     -2370.372586619        67.556102037      3980         1990.000000         0.465900641       279.429460220     -2373.099082026     -2370.372684263        76.962266922      3990         1995.000000         0.450246868       270.040923331     -2373.087063109     -2370.371947353        68.042631149      4000         2000.000000         0.458024384       274.705581585     -2373.082490350     -2370.371942815        67.633645058      4010         2005.000000         0.455150729       272.982072598     -2373.099321281     -2370.372651569        67.668117046      4020         2010.000000         0.492625498       295.458011450     -2373.139838152     -2370.373074594        67.646747828      4030         2015.000000         0.473892952       284.222944031     -2373.121942090     -2370.373181966        67.785763025      4040         2020.000000         0.502305148       301.263497118     -2373.148017864     -2370.373927941        67.868869066      4050         2025.000000         0.505149987       302.969723468     -2373.153554300     -2370.373384706      1286.867120981      4060         2030.000000         0.485675769       291.289829048     -2373.133253656     -2370.372950823      1222.631000996      4070         2035.000000         0.462755255       277.542977703     -2373.129295826     -2370.372541675       687.871176958      4080         2040.000000         0.470894469       282.424568277     -2373.126909142     -2370.371939148      2357.914371967      4090         2045.000000         0.457195995       274.208745478     -2373.116683742     -2370.371460260      1175.034868956      4100         2050.000000         0.439054488       263.328160394     -2373.098414834     -2370.370188867       638.787050962      4110         2055.000000         0.463669118       278.091077567     -2373.115282563     -2370.370098537      1164.508292913      4120         2060.000000         0.455513606       273.199712436     -2373.110187483     -2370.370783224      1174.876551867      4130         2065.000000         0.471881288       283.016424388     -2373.113322837     -2370.370647886      1185.692931890      4140         2070.000000         0.466999351       280.088424858     -2373.107402878     -2370.370877377      1175.991256952      4150         2075.000000         0.491675077       294.887985488     -2373.140123274     -2370.371007238      1198.926747084      4160         2080.000000         0.468795115       281.165455732     -2373.121103471     -2370.370412862      1233.599603891      4170         2085.000000         0.502428311       301.337365690     -2373.155216771     -2370.371468193      1345.183628798
<br>
<br>
<br>Crazy Wannier localization not converged after   3000 iterations, switching to jacobi rotations         Localization by iterative distributed Jacobi rotation                      Iteration            Functional         Tolerance   Time               Localization  for spin   2 converged in     79 iterations          Spread Functional     sum_in -w_i ln(|z_in|^2)    sum_in w_i(1-|z_in|^2)    Total Spread (Berry) :                2612.7381541523     2561.3576511947
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>Thanks in advance for the help!Best,Tommy
<br>Tommaso FrancesePhD Student (ITN-EJD-TCCM)Universitat de BarcelonaDepartamento de Química-FísicaMartí i Franquès 1Planta 4a08028 BarcelonaSpain
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>-- 
<br>
<br>You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.
<br>
<br>To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp2k+uns...@googlegroups.<wbr>com</a>.
<br>
<br>To post to this group, send email to <a href="javascript:" target="_blank" gdf-obfuscated-mailto="BrsamvtvBwAJ" rel="nofollow" onmousedown="this.href='javascript:';return true;" onclick="this.href='javascript:';return true;">cp...@googlegroups.com</a>.
<br>
<br>Visit this group at <a href="https://groups.google.com/group/cp2k" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://groups.google.com/group/cp2k';return true;" onclick="this.href='https://groups.google.com/group/cp2k';return true;">https://groups.google.com/<wbr>group/cp2k</a>.
<br>
<br>For more options, visit <a href="https://groups.google.com/d/optout" target="_blank" rel="nofollow" onmousedown="this.href='https://groups.google.com/d/optout';return true;" onclick="this.href='https://groups.google.com/d/optout';return true;">https://groups.google.com/d/<wbr>optout</a>.
<br>
<br>
<br></blockquote></div></div>