<div dir="ltr">Hi Marcella,<div><br></div><div>Thanks for your information.</div><div>I try to plot the FES with the sub-program that is compiled with cp2k. However, I got the following error. </div><div><span style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 14px;">fes.sopt -cp2k -ndim 1 -ndw 1 -file bulk-HNCO-1.restart</span><br style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 14px;"><div style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 14px;"><br></div><div style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 14px;"><div>******************************<wbr>******************************<wbr>**********</div><div>FES|  Parsing file:   <bulk-HNCO-1.restart></div><div><br></div><div>At line 185 of file /opt/programs/cp2k-2.4.0/<wbr>makefiles/../tools/metadyn/<wbr>graph_utils.F</div><div>Fortran runtime error: Bad real number in item 1 of list input.</div><div><br></div><div>Did you use the sub-program in cp2k to calculate FES before? Any suggestion for my error would be appreciated.</div><div><br></div><div>Best</div><div>Jie</div><div><br></div></div><br>在 2016年11月12日星期六 UTC-6上午5:11:16，Marcella Iannuzzi写道：<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">Hi Jie,<div><br></div><div>Indeed in the restart file all required information to build the free energy hyper surface are stored, i.e, positions, widths and heights of the hills. To sum up the Gaussians you can use the tool that you prefer.</div><div>As previously suggested the tool provided with plumed would be a solution.</div><div>Another possibility would be the sub-program graph that is compiled together with cp2k.</div><div><br></div><div>Kind regards</div><div>Marcella</div><div><br>On Tuesday, November 8, 2016 at 4:46:55 PM UTC+1, Jie Zhong wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi all,<br><br><div>I am trying to get familiar with cp2k metadynamics method. I have finished the calculation.<br></div><div>I was told to use the restart file to plot free energy profile as function of collective variable. How can I do it?</div><div>The restart file has been attached.</div><div>Any suggestion is appreciated.</div><div><br></div><div>Best</div><div>Jie</div><div><br></div><div><br></div></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div>