<div dir="ltr"><div>Dear Matt,</div><div><br></div>Thank you for your reply.<div><br></div><div>I made a QS-MD test, using unwrapped atomistic coordinates with cell length much smaller than the spatial scale of an unwrapped PU chain.</div><div>It has run for 2 days and completed approximately 100 time steps. Visualizing the trajectory file, the whole chain keeps in unwrapped</div><div>coordinate. I am testing to see if related physical quantities are the same as using wrapped coordinates.</div><div><br></div><div>It seems that we may be able to use unwrapped coordinate to let CP2K dump unwrapped coordinate. This could be helpful</div><div>if we need to analyse if chemical reaction takes place during simulation.</div><div><br></div><div>Regard</div><div>Yiyang</div><div><br>On Monday, October 31, 2016 at 12:15:52 PM UTC-7, Matt W wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">CP2K trajectories, to my knowledge, are always unwrapped - I mean if you run MD and something diffuses you will see it leaving the 'central' cell.<div><br></div><div>Matt<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><br></div></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div>