<div dir="ltr"><p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif">Dear Dorothea, thanks for your comments.</font></span></p><p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><br></font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif">I think water at SPC model + Siepmann potential cannot
be dissociated. The Siepmann terms are affected only on Pt-O iterations.
Dissociation can occur with the separate iterations (Pt-O and Pt-H) and a
flexible water models (or dissociations model). Previous calculations (graphite
slab+water, metal ions+water) doesn’t show any bugs with the SPC model in cp2k,
all intermolecular distance was fixed during calculation.</font></span></p><p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><br></font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif">The problem of temperature jumps was fixed by adding
REGION MOLECULE in &TERMOSTAT. Now energies and temperature seems quite
plausible. </font></span></p><p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><br></font></span></p>

<p class="MsoNormal"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><span lang="EN-US" style="line-height:115%">Main tendency of previous calculation is a drift </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">Cons Qty</span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">.
Often the terminations are caused by atoms of water on peripheries of cell. </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">Probably, the
termination of all tasks is associated with boundary conditions.</span><span lang="EN-US" style="line-height:115%"> </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">On
cp2k forum I found useful theme: </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><b>Energy conservation NVT/NVE simulation</b> </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><a href="https://groups.google.com/forum/#!topic/cp2k/ZNEiZIFMbKM" target="_blank">https://groups.google.com/<wbr>forum/#!topic/cp2k/ZNEiZIFMbKM</a> </span></font><span style="font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;"><span lang="EN-US" style="line-height:115%;color:windowtext;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial">This topic has comprehensive information about stability
of the calculation. </span></span><span lang="EN-US" style="font-family: verdana, sans-serif; font-size: small; line-height: 115%;">Dorothea, you were really right at the expense of the <span style="background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial">MD setup and parameters.</span></span></p>

<p class="MsoNormal"><span><span lang="EN-US" style="line-height:115%;color:windowtext;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><br>Mention above problems is fixed by adding:<br><br></font></span></span></p>

<p><font size="2" face="verdana, sans-serif"><span><span lang="EN-US" style="color:windowtext;line-height:115%">-<span style="font-stretch:normal;line-height:normal">     -  </span></span></span><span><span lang="EN-US" style="line-height:115%;color:windowtext;background-image:initial;background-position:initial;background-repeat:initial">in &constraint</span></span></font></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span lang="EN-US"><font size="2" face="verdana, sans-serif">SHAKE_TOLERANCE … (more than the default values)</font></span></p>

<p class="MsoNormal"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><span style="line-height:115%">ROLL_TOLERANCE </span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">…<br><br></span></font></p>

<p><font size="2" face="verdana, sans-serif"><span lang="EN-US" style="line-height:115%">-<span style="font-stretch:normal;line-height:normal">     -  </span></span><span lang="EN-US" style="line-height:115%">in &ewald</span></font></p>

<p class="MsoNormal"><font size="2" face="verdana, sans-serif"><span style="line-height:115%">ALPHA</span><span lang="EN-US" style="line-height:115%"> should be increased
>0.5</span></font></p>

<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif"> </font></span></p>

<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="line-height:115%"><font size="2" face="verdana, sans-serif">Now all calculations with the siepmann potential are
stable.<br><br></font><span style="font-size:12pt"></span></span></p><br>пятница, 13 ноября 2015 г., 0:04:19 UTC+3 пользователь Dorothea Golze написал:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Hi Sergey,<br><br></div>the Siepmann-Sprik potential assumes intact water molecules at the interface. In your case, some dissociation seems to take place. It is checked with a simple distance criterion if we have 2 hydrogens per oxygen. You get the error message:  <span style="font-size:8pt;font-family:"Lucida Console"" lang="EN-US"><b>Error in
Siepmann-Sprik part: too many H atoms, </b></span>i.e. more than 2 hydrogen per oxygen found. <br></div>The keyword ALLOW_OH_FORMATION ignores that and doesn't calculate the T3 term of the Siepmann-Sprik potential for this MD step. So the program won't stop. This keyword was actually intended for cases where water is described at the QM level, but you can try it as well. <br></div>It's  strange that you have this behavior at the SPC level. However, the temperature development of your MD is very weird and has extreme jumps. So it's maybe not surprising that your O-H bonds are strangely stretched. So better control your MD setup and parameters. <br></div>btw: examples for the Siepmann-Sprik potential can be found in the regtests: /cp2k/tests/Fist/regtest-6/<br><br></div>Best regards,<br></div>Dorothea<br></div><div><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span><font color="#888888"><br>
</font></span></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div>