<div dir="ltr">There is an ANNEALING variable in the MD section. My understanding is that at each step velocities would be rescaled by this factor (I've never used it).<div><br></div><div>Matt<br><div><br><div>On Wednesday, July 15, 2015 at 9:41:57 AM UTC+1, Samuel Andermatt wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr">I don't think you can change the temperature over the course of a simulation, you will have to do multiple runs, one for each temperature. Fixed cell you have by choosing the NVT ensamble.<br></div></blockquote></div></div></div></div>