<div dir="ltr">Maybe the cell size ?<div><br></div><div>Also you can use molden and you can see the cell. From input it's 26A 17A 17A and one water molecule seems out of place, another is H3O+ (normal ?). </div><div>Also check periodicity of your system ? Maybe a CELL_OPT ?</div><div><br>You have water and also void. Depends on what is your goal. I can't help you further as at lack expertise and informations about this kind of runs.</div></div>