<div dir="ltr">Thank you Janos for your helpful suggestions. I am using PM3 as a reference calculation. It's not giving experimental enthalpy of vaporization.<div><div><br></div><div>Bharat</div><div><br><br>On Monday, December 8, 2014 12:58:54 PM UTC-5, Jano...@googlemail.com wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear Bharat,<div><br>I am not convinced about the usage of semiempericals like PM3 for such a purpose, but it is your business... </div><div>Concerning the approach:</div><div>Calculating internal energy is simply calculating the average of the total energy.  But, as the average of the kinetic energy is defined on a given temperature (I assume, you run NVT simulations), I usually calculate the average of the potential energy. The contribution from kinetic energy should cancel when you subtract the liquid phase value from the gas phase value.</div><div><br></div><div>Both potential energy and total energy are reported in the *.ener file in cp2k.</div><div><br></div><div>Otherwise do you get the right value by simply adding RT to dU? Just to test your approximation:</div><div>why don't you add d(pV), that you can calculate from experimental densities.</div><div><br></div><div><br></div><div>Janos<br><br>On Monday, December 8, 2014 3:43:56 PM UTC+1, bharat wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Samuel,<div>It's a semiempirical calculation. I does not have any functional forms like GGA or hybrid. Calculation is correct because I was able to reproduce other properties. Isn't internal energy "Total energy" in CP2K? if not how do I calculate internal energy from cp2k results?</div><div><br></div><div>Thanks.</div><div><br></div><div>Bharat<br><br>On Monday, December 8, 2014 3:52:56 AM UTC-5, Samuel Andermatt wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">You will need to post your input and output files. Do you do GGA or hybrid calculations, how do you account for the vdW forces?<br><br>On Friday, December 5, 2014 4:17:45 PM UTC+1, bharat wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello,<div>This is friendly reminder. Any suggestions?</div><div><br></div><div>Bharat<br><br>On Wednesday, December 3, 2014 12:56:10 PM UTC-5, bharat wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello Experts,<div style="line-height:21.299999237060547px"><br style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">I am trying to reproduce Enthalpy of vaporization using PM3.</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">Here are my calculation: </div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">(I took Total energy value from CP2K output file as an Internal energy, average is calculated over the MD. Experimental density is used for the constant volume for both liquid and vapor calculation). Am I taking correct energy value for internal energy? </div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">U_vapor(Avg) = -20797.3 eV </div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">U_liquid(Avg) = -20802.9 eV</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">Delta_U = 5.6 eV <br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">I divided with 64 (# of water molecules) and converted to kcal/mol</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">= 2.02 kcal/mol</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">I got the half value (reported value is 4.00 kcal/mol in G. Murdachaew et al. J. Phys. Chem. A 115, 6046 (2011)). Because of this value, I got only ~2.60 kcal/mol (RT= ~0.60 kcal/mol) of enthalpy of vaporization (Delta_H = delta_U + RT). </div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">Can anyone please tell me where I am doing wrong? Where is the factor 2 missing?</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">Thank you.</div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><br></div><div style="color:rgb(68,68,68);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px">Bharat </div><div><br></div></div></div></blockquote></div></div></blockquote></div></blockquote></div></div></blockquote></div></div></div></div></blockquote></div></div></div>