<div dir="ltr">Dear CP2K group,<br><br><br>being a relatively new cp2k user, I was wondering if this group could give me some advice on the choice of (REL) CUTOFF values.<br>The system I am considering is a somewhat extended molecular crystal 
structure, containing organometallic fragments (basically a rhodium 
phosphine complex with additional ligand plus large borate counteranions (BArF4-).The full system contains about 600+ atoms in the unit cell, basically 4 cation/anion pairs <br>(asymmetric units). I think the system cannot be reduced in size, and the full unit cell has to be taken into account.I have attached a cif file which gives you<br>an idea about the kind of system (not exactly the one used in the calculation below, but very much related)<br> <br>The basic idea behind determining the CUTOFF is clear to me and I have done the tutorial on bulk Si. I have used the same protocol for my system <br>(running a series of calculations with varying CUTOFF and REL_CUTOFF values). In contrast to the suggested method in the tutorial, I have <br>fully converged the SCF cycle) Below are the (first) results of this series. The energy appears to be converging towards higher CUTOFF values (some more calculations are currently running)<br><br>(1) I wonder if choosing such a large value for the cutoff is reasonable? It should also increase the accuracy of the calculations, but also the cost.<br>Also, with respect to the number of Gaussian being mapped onto the finest grid, what would one need to look for?  <br>In the tutorial the decision was 
based on the fact that "the
distribution of Gaussian functions on the grids are reasonable". Could 
somebody elaborate on this <br>and give me some guidance how to decide
 this?<br>(2) How does the size of the CUTOFF value correlate with the system size, if there is any correlation?  <br>(3) Are there some rule of thumbs as how to choose the REL_CUTOFF with respect to the CUTOFF? For now I have tried 30, 60 and 100 Ry.<br>But I may need to go to higher numbers in this particular case. <br><br><br><br># Grid cutoff vs total energy<br># Date: Tue Jun 10 17:26:55 BST 2014<br># REL_CUTOFF = 60<br># Cutoff (Ry) | Total Energy (Ha) | Charge | SCF | | NG on grid 1 | NG on grid 2 | NG on grid 3 | NG on grid 4<br>     50.00  -4583.1402739393   -8.4046446120  200  1623260  248362    2112       0<br>    100.00  -4477.8479306771   -0.0745436930  128  1264867  519816   89051       0<br>    150.00  -4479.5978060995   -0.0191170935  128  1150415  472845  248362    2112<br>    200.00  -4478.5030451759    0.0008175249  128  905641  531280  432781    4032<br>    250.00  -4478.4529157377   -0.0000917804  128  838757  500556  523109   11312<br>    300.00  -4478.4141842105   -0.0000534995  128  796882  467985  519816   89051<br>    350.00  -4478.3827319182   -0.0000170792  128  748308  474790  454036  196600<br>    400.00  -4478.3597765363    0.0000003328  128  679828  499675  489931  204300<br>    450.00  -4478.3498795935    0.0000000149  128  621687  528728  472845  250474<br>    500.00  -4478.3399690553    0.0000000147  128  567997  416013  600098  289626<br>    550.00  -4478.3338555119   -0.0000000007  128  485909  446314  559882  381629<br>    600.00  -4478.3312330111    0.0000000007  128  442629  463012  531280  436813<br>    650.00  -4478.3291405214    0.0000000006  128  399089  473084  554024  447537<br>    700.00  -4478.3308119206    0.0000000008  128  375655  473218  509402  515459<br>    750.00  -4478.3298871109    0.0000000008  128  365399  473358  500556  534421<br>    800.00  -4478.3266993684    0.0000000007  128  353459  468098  461722  590455<br>    850.00  -4478.3266987930    0.0000000007  128  348184  458373  472494  594683<br>    900.00  -4478.3273848891    0.0000000007  128  336984  459898  467985  608867<br>    950.00  -4478.3277135782    0.0000000007  128  309758  476872  469877  617227<br>   1000.00  -4478.3277705414    0.0000000008  128  291089  482269  455857  644519<br>   1050.00  -4478.3278605666    0.0000000007  128  229036  519272  474790  650636<br><br>Some further questions;<br><br>(4) Could you recommend some literature (books) which explains the theory of solid state calculations, k-sampling, planewaves?<br><br>(5) As a next step I would like to manipulate the structure, i.e. rotate/move ligands around? Is there a good visualizer that can do such <br>things for periodic systems? The problem I am facing is that I would like to do these things simultaneously for all 4 asymmetric units.<br>I think it becomes impracticable to do this for each unit separately. I have started using GDIS but I am a little bit uncertain about its<br>abilities (great program though!!). Has anyone experience with VESTA? I am particularly looking for free software. <br><br><br>Thank you very much for your help, this is very much appreciated. There are a lot of questions right a the beginning, and it is not always easy to <br>find some answers.   <br><br>Best<br><br><br>Tobias<br><br><br><!--[if gte mso 9]><xml>
 <w:WordDocument>
  <w:View>Normal</w:View>
  <w:Zoom>0</w:Zoom>
  <w:TrackMoves/>
  <w:TrackFormatting/>
  <w:PunctuationKerning/>
  <w:ValidateAgainstSchemas/>
  <w:SaveIfXMLInvalid>false</w:SaveIfXMLInvalid>
  <w:IgnoreMixedContent>false</w:IgnoreMixedContent>
  <w:AlwaysShowPlaceholderText>false</w:AlwaysShowPlaceholderText>
  <w:DoNotPromoteQF/>
  <w:LidThemeOther>EN-GB</w:LidThemeOther>
  <w:LidThemeAsian>X-NONE</w:LidThemeAsian>
  <w:LidThemeComplexScript>X-NONE</w:LidThemeComplexScript>
  <w:Compatibility>
   <w:BreakWrappedTables/>
   <w:SnapToGridInCell/>
   <w:WrapTextWithPunct/>
   <w:UseAsianBreakRules/>
   <w:DontGrowAutofit/>
   <w:SplitPgBreakAndParaMark/>
   <w:DontVertAlignCellWithSp/>
   <w:DontBreakConstrainedForcedTables/>
   <w:DontVertAlignInTxbx/>
   <w:Word11KerningPairs/>
   <w:CachedColBalance/>
  </w:Compatibility>
  <w:BrowserLevel>MicrosoftInternetExplorer4</w:BrowserLevel>
  <m:mathPr>
   <m:mathFont m:val="Cambria Math"/>
   <m:brkBin m:val="before"/>
   <m:brkBinSub m:val="--"/>
   <m:smallFrac m:val="off"/>
   <m:dispDef/>
   <m:lMargin m:val="0"/>
   <m:rMargin m:val="0"/>
   <m:defJc m:val="centerGroup"/>
   <m:wrapIndent m:val="1440"/>
   <m:intLim m:val="subSup"/>
   <m:naryLim m:val="undOvr"/>
  </m:mathPr></w:WordDocument>
</xml><![endif]-->

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">Dr. Tobias Kraemer</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">Research Associate</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">Institute of Chemical Sciences</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">School of Engineering & Physical Sciences</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">Heriot-Watt University </span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">Edinburgh EH14 4AS</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-font-family:"Times New Roman";
mso-fareast-theme-font:minor-fareast;color:black;mso-fareast-language:EN-GB;
mso-no-proof:yes">United Kingdom</span></p>

<br></div>