<div dir="ltr"><div><div><div>Hi SeokYun,<br></div><br></div>I'm also facing the same problem while performing a QM/MM simulation of an organic molecule in water. Could you please elaborate how you have rectified the issue. <br>
<br></div>regards,<br>tarak<font color="#888888"> </font><span class=""></span><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 23, 2013 at 11:43 AM, SeokYun <span dir="ltr"><<a href="mailto:kimse...@gmail.com" target="_blank">kimse...@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">I'm sorry. <br><br>I figured out what is wrong with my files.<br><br>Thank you.<div class=""><br><br>On Tuesday, January 22, 2013 5:24:07 PM UTC-5, SeokYun wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">Hello all,</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">I was trying to run my molecular dynamics calculation, but I obtained this error that I'm not so sure how to fix.</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">*** ERROR in build_neighbor_lists (MODULE fist_neighbor_lists) ***</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica"> *****************************<u></u>******************************<u></u>*******</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica"> *** GEOMETRY wrong or EMAX_SPLINE too small! ***</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica"> *** Program stopped at line number 619 of MODULE fist_neighbor_lists ***</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica"> ===== Routine Calling Stack ===== </p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            6 build_neighbor_lists</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            5 build_fist_neighbor_lists</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            4 list_control</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            3 fist_force_control</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            2 qs_mol_dyn_low</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">            1 CP2K</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">Referring to the old posts, I try to fix the error, but I wasn't able to do so. </p><p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">I looked over the geometry of my molecules multiple times and I don't see anything wrong with it. I also tried to increase EMAX_SPLINE as instructed, but it did not work. It produced exactly the same error.</p>

<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">The size of the supercell should also be correct because I calculated and made sure that the dimensions are correct.</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">Could this be a problem with the compiler or is there anything wrong with the files?</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">I attached all my files. It's all in .txt file as it did not allow me to attach files other than .txt.</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">Thank you very much.</p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica;min-height:14.0px"><br></p>
<p style="margin:0.0px 0.0px 0.0px 0.0px;font:12.0px Helvetica">SeokYun</p></blockquote>

<p></p>

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