<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>thanks all the same. <br></div>i have solved the problem with "temp_TOL" to limit the tolerance.<br><br><br></div>but could you help find why it can't print the data about MULLIKEN??<br>
<br></div>my input file is in the attachment.<br><br></div>best regards!<br><br></div>Xianjin<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2013/12/19 Samuel Andermatt <span dir="ltr"><<a href="mailto:samuel.a...@student.ethz.ch" target="_blank">samuel.a...@student.ethz.ch</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Ok, sorry I thought your substance would be in a solvent.<div class="im"><br><br>On Thursday, December 19, 2013 7:42:48 AM UTC+1, Jj Ll wrote:</div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="im">    At first , i appreciate your help very much.<br>
i try to use constraint of my atom positions.  fix_atom -->list 1 ..112 (112 atoms)<br></div>but it turn out a error  ,see the file "tdtest.out". what 's wrong ?  in cp2k 2.2 and 2.3 <br>it seems that we can't fix all atoms.<div class="im">
<br><br>my input file is here.<br><br><br><br>by the way, why there is no  data of mullken affter the run.<br><br>   &MULLIKEN SILENT<br>        FILENAME ./mulliken.out<br>      &END MULLIKEN<br><br>thanks!<br>best regards.<br>
xianjin<br><br><br><br><br><br>在 2013年12月18日星期三UTC+8下午9时48分28秒，<u></u>Samuel Andermatt写道：<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div dir="ltr">
You can constrain your system using parameters found in the section <a href="http://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/CONSTRAINT.html" target="_blank">http://manual.cp2k.org/trunk/<u></u>CP2K_INPUT/MOTION/CONSTRAINT.<u></u>html</a> .<br>
<br>For your case you could do an MD simulation with the positions of the atoms of your substance fixed (<a href="http://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/MOTION/CONSTRAINT/FIXED_ATOMS.html" target="_blank">http://manual.cp2k.org/trunk/<u></u>CP2K_INPUT/MOTION/CONSTRAINT/<u></u>FIXED_ATOMS.html</a>) . I assume your substance is in a solvent.<br>
After your system equilibrated (temperatures no longer fluctuate) you could use the coordinates as input for a second simulation, where you remove the constraint of your atom positions.<br><br></div></div></blockquote></div>
</div></div></div></blockquote></div><div class="HOEnZb"><div class="h5">

<p></p>

-- <br>
You received this message because you are subscribed to a topic in the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this topic, visit <a href="https://groups.google.com/d/topic/cp2k/nYzykcmlEsc/unsubscribe" target="_blank">https://groups.google.com/d/topic/cp2k/nYzykcmlEsc/unsubscribe</a>.<br>
To unsubscribe from this group and all its topics, send an email to <a href="mailto:cp2k%2Bun...@googlegroups.com" target="_blank">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
Visit this group at <a href="http://groups.google.com/group/cp2k" target="_blank">http://groups.google.com/group/cp2k</a>.<br>
For more options, visit <a href="https://groups.google.com/groups/opt_out" target="_blank">https://groups.google.com/groups/opt_out</a>.<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>