<div dir="ltr">I have tried. So far, unsuccessfully. ALMO SCF is designed for molecular systems, i.e. for weakly-interacting fragments. It will not work if boundaries between fragments cross covalent bonds. The SCF will not converge.<br><br>On Tuesday, October 22, 2013 10:07:01 PM UTC-7, Joe Greenstone wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0;margin-left: 0.8ex;border-left: 1px #ccc solid;padding-left: 1ex;"><div dir="ltr"><div>Thanks, Rustam. </div><div><br></div><div>> 1. assign unique molecule names (MOL1, MOL2, MOL3) to split large molecules into smaller ones</div><div><br></div><div>Has someone tried this for a protein molecule? If so, what strategy was used to split the molecule into smaller ones?   </div></div></blockquote></div>