<div dir="ltr">Hi,<div style>     It should be calculated as follows. </div><div style><br></div><div style>timestep*dumping_frequency</div><div style><br></div><div style>timestep = 0.5 fs =  20.665 a. u. </div><div style>
<br></div><div style>dump_frequency = how often are you calculating the dipole moment and dumping it to the output file. From your input file, i believe it is 1. </div><div style><br></div><div style>so sampling frequency =  20.665*1 = 20.665   </div>
<div style><br></div><div style><br></div><div style>Hope this helps.</div><div style><br></div><div style>Regards,</div><div style>Sandeep</div><div style><br></div><div style>PS: You need not calculate dipole moment of the system at every MD step. To save CPU time, you can calculate dipole moment at every 5th MD step.  In this case, the sampling frequency is 103.325 (20.665*5). </div>
<div style><br></div><div style><br></div><div style><br></div><div style><br></div><div style><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 16, 2013 at 3:40 AM, Jana <span dir="ltr"><<a href="mailto:jahodov...@gmail.com" target="_blank">jahodov...@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Wagner,<div><br></div><div>it is sorted, thanks for the remark though.<br></div><div><br></div><div><br></div><div>
<br></div><div>I am a bit puzzled by the post-processing - <i>give time difference in input file (in atomic units):</i></div><div><i> [CAUTION: this is the MD time step times the sampling frequency.]</i></div><div><br></div>
<div>The sample value in the fourier transform utility was 17. My time step is 0.5 fs but how do I find out what the sampling frequency is? I understand I should find out after how many samples I save one, but how do I get that?</div>
<div><br></div><div>Originally I used the <i>Used time</i> column in *ener file but JQ found out it wasn't it.</div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div><br></div><div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div><br></div>
</blockquote></div>

<p></p>

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to <a href="mailto:cp2k%2Bun...@googlegroups.com" target="_blank">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
Visit this group at <a href="http://groups.google.com/group/cp2k" target="_blank">http://groups.google.com/group/cp2k</a>.<br>
For more options, visit <a href="https://groups.google.com/groups/opt_out" target="_blank">https://groups.google.com/groups/opt_out</a>.<br>
 <br>
 <br>
</div></div></blockquote></div><br></div>