Dear all, <div>I have managed to compile cp2k-2.3 at a supercomputer using their mklroot, mpi and my fftw and libint but there is a problem with run while using different nodes probably due to the old version of mpi available...so i was sent another version compiled by another user at the same supercomputer but the user didn't use anything default, all libs his own.</div><div><br></div><div>I got his binary and dynamically linked libs via cp -a so with links, but I keep getting</div><div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;">$ ldd ./bin/mpiexec<br>        linux-vdso.so.1 =>  (0x00007fff12a74000)<br>        libopen-rte.so.4 => not found</blockquote></div><div>or </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;">$ ldd /storage/home/his-username/bin/mpiexec<br>        linux-vdso.so.1 =>  (0x00007fff2cdff000)<br>        libopen-rte.so.4 => not found</blockquote><div><br></div><div>while he has at the same time</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;"><span style="font-family: arial, sans-serif;">$ ldd /home/his-username/storage/bin/</span><wbr style="font-family: arial, sans-serif;"><span style="font-family: arial, sans-serif;">mpiexec<br></span><span style="font-family: arial, sans-serif;">        linux-vdso.so.1 =>  (0x00007fff57d33000)<br></span><span style="font-family: arial, sans-serif;">        libopen-rte.so.4 => /home/his-username/CP2K/lib/libopen-</span><wbr style="font-family: arial, sans-serif;"><span style="font-family: arial, sans-serif;">rte.so.4 (0x00007fdb28ffd000)</span></blockquote><div><br></div><div>I changed my script for PBS so that I added the red line<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;">...<br>echo 'export LD_LIBRARY_PATH=/storage/home/$USER/lib' >> $go<br>echo 'export PATH=/storage/home/$USER/bin:'$PATH >> $go<br>echo 'echo "env:"; env' >> $go<br>echo 'echo "nodes:"; cat $PBS_NODEFILE; echo libs:; ls /storage/home/$USER/lib; echo bin:; ls /storage/home/$USER/bin' >> $go<br><font color="#cc0000">echo 'export LD_LIBRARY_PATH=/storage/home/$USER/lib/libopen-rte.so.4' >> $go<br></font>echo /storage/home/$USER/bin/'mpiexec --hostfile $PBS_NODEFILE -x LD_LIBRARY_PATH='$LD_LIBRARY_PATH' -x PATH='$PATH' cp2k.popt '$base'.in > '$base'.log 2>&1' >> $go<br>...</blockquote><div><br></div><div>but in the logfile (using input for h2o from regtests) I keep getting</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0px 0px 0px 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex;">/storage/home/mathausj/bin/mpiexec: error while loading shared libraries: libopen-rte.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory</blockquote><div><br></div><div><br></div><div>though</div><div><br></div><div><br></div><div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">$ ls lib</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">total 15936</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">-rwxr-xr-x 1 mathausj meta    20323 2013-03-14 09:59 libmpi_f90.so.3</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">-rwxr-xr-x 1 mathausj meta  2002819 2013-03-14 09:59 libmpi_f77.so.1</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">-rwxr-xr-x 1 mathausj meta 10282011 2013-03-14 09:59 libmpi.so.1</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">-rwxr-xr-x 1 mathausj meta  4006084 2013-03-14 16:52 libopen-rte.so.4</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;"><br></div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;"><br></div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;">I am sorry to bother you with this problem, but I am really clueless... Have emailed helpdesk and the user who compiled it but none of them has solution to this problem, if executed from that user's account, cp2k works perfectly...</div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;"><br></div><div style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: verdana, sans-serif; font-size: small;"><br></div></div>