Hi Matt<div><br></div><div>Thanks. I have instantaneous time per MD step printed in cp2k output file and it indeed shows that while for a normal run, it ranges from 7.5 to 10.5 seconds, but for this slow run, it is above 700-1000 seconds for some of the initial steps and then becomes fast down the road to the normal range except occasional slow downs to 45-60 seconds...</div>
<div><br></div><div>Thanks</div><div>Chetan<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Jul 1, 2012 at 3:08 AM, Matt W <span dir="ltr"><<a href="mailto:MattWa...@gmail.com" target="_blank">MattWa...@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div>Not easily without more data.<br></div><div><br></div><div>The only simple thing (if your system if running stably) is the file system slowing down for whatever reason.</div>
<div>Are individual SCF (electronic) steps slowing down too?</div><div><br></div><div>Matt </div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>On Saturday, June 30, 2012 10:38:10 PM UTC+1, Chetan Mahajan wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0;margin-left:0.8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif">Hi</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif">
<br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif">I am running AIMD simulations for one system using cp2k on a TACC lonestar machine. While it could complete 7900-8800 timesteps for most of the runs in 1 day on 180 cores, the timesteps completed dropped to 4100 in the recent run in the same time on same number of cores. While I do anticipate certain variation in the performance from run to run, this much variation is surprising. Is it so? Can you also speculate on the reasons?</div>

<div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif">
Thanks</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-size:13px;font-family:arial,sans-serif">Chetan</div><br><div><br></div>-- <br>Chetan V Mahajan<br>PhD candidate, Ganesan Group<br>
Department of Chemical Engineering<br>The University of Texas at Austin<br><br>
</blockquote>

<p></p></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">

-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To view this discussion on the web visit <a href="https://groups.google.com/d/msg/cp2k/-/R68zuZ0W7cEJ" target="_blank">https://groups.google.com/d/msg/cp2k/-/R68zuZ0W7cEJ</a>.<br> 
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
To unsubscribe from this group, send email to <a href="mailto:cp2k%2Bun...@googlegroups.com" target="_blank">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>

For more options, visit this group at <a href="http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en" target="_blank">http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en</a>.<br>


</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Chetan V Mahajan<br>PhD candidate, Ganesan Group<br>Department of Chemical Engineering<br>The University of Texas at Austin<br><br>
</div>