Hi Matthias, <div><br></div><div>Many thanks for your suggestion. </div><div>It is really basis set dependent. I've tried again with most basis sets I have, only the MOLOPT-SR types can give me some "right physics" results.</div>
<div>Btw, could you please tell me some technical papers about this problem?</div><div><br></div><div>Thanks again, </div><div>Manh</div><div><br></div><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8"><div>
<br><div class="gmail_quote">On Sun, Dec 5, 2010 at 3:06 PM, Matthias Krack <span dir="ltr"><<a href="mailto:matthia...@psi.ch">matthia...@psi.ch</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Hi Manh,<br>
<br>
population analyses are known to be very sensible to the basis set<br>
choice. I guess also in this case the TZV2P MOLOPT basis set is the<br>
reason for the unexpected result. The MOLOPT basis sets include<br>
relatively small exponents which might cause linear dependencies in<br>
the overlap matrix. The Lowdin population analysis requires the<br>
calculation of S**(1/2) which involves (in CP2K) a diagonalisation of<br>
the overlap matrix. However, an ill-conditioned overlap matrix will<br>
most likely result in a weird charge partition. Therefore, I would<br>
suggest to employ different basis sets, e.g. the MOLOPT-SR or the DZVP/<br>
TZVP basis sets.<br>
<br>
Best,<br>
<font color="#888888"><br>
Matthias<br>
</font><div><div></div><div class="h5"><br>
On 3 Dez., 17:46, Manh <<a href="mailto:manht...@gmail.com">manht...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Hello everyone,<br>
><br>
> I calculate the Mulliken and Lowdin charges for a water molecule. The<br>
> results are:<br>
><br>
> ----------------------------------------------------------------<br>
><br>
>  MULLIKEN POPULATION ANALYSIS<br>
><br>
>  # Atom  Element  Kind  Atomic population                Net charge<br>
>       1     H        1           0.780838                  0.219162<br>
>       2     H        1           0.780981                  0.219019<br>
>       3     O        2           6.438182                 -0.438182<br>
>  # Total charge                  8.000000                  0.000000<br>
><br>
>  LOWDIN POPULATION ANALYSIS<br>
><br>
>  # Atom  Element  Kind  Atomic population                Net charge<br>
>       1     H        1           1.210449                 -0.210449<br>
>       2     H        1           1.210473                 -0.210473<br>
>       3     O        2           5.579079                  0.420921<br>
>  # Total charge                  8.000000                  0.000000<br>
><br>
> --------------------------------------------------------<br>
><br>
> I think that the Lowdin analysis has some problem.<br>
><br>
> Here is my input:<br>
><br>
> ---------------------------------------------<br>
><br>
> &FORCE_EVAL<br>
>   METHOD Quickstep<br>
>   &DFT<br>
>     BASIS_SET_FILE_NAME ../../../BASIS_MOLOPT<br>
>     POTENTIAL_FILE_NAME ../../../GTH_POTENTIALS<br>
>     RESTART_FILE_NAME H2O-RESTART.wfn.wfn<br>
>     &QS<br>
>       METHOD GPW<br>
>       EXTRAPOLATION ASPC<br>
>       EXTRAPOLATION_ORDER 3<br>
>     &END QS<br>
>     &MGRID<br>
>       CUTOFF 400<br>
>       NGRIDS 5<br>
>     &END<br>
>     &SCF<br>
>       MAX_SCF 20<br>
>       SCF_GUESS RESTART<br>
>       EPS_SCF 1.0E-6<br>
>       &OT<br>
>         PRECONDITIONER  FULL_SINGLE_INVERSE<br>
>         MINIMIZER  CG<br>
>       &END<br>
>       &OUTER_SCF<br>
>         MAX_SCF 10<br>
>         EPS_SCF 1.0E-6<br>
>       &END<br>
>       &PRINT<br>
>         &RESTART<br>
>           &EACH<br>
>             QS_SCF 0<br>
>             GEO_OPT 2<br>
>           &END<br>
>           ADD_LAST NUMERIC<br>
>           FILENAME RESTART.wfn<br>
>         &END<br>
>         &RESTART_HISTORY OFF<br>
>         &END<br>
>       &END<br>
>     &END SCF<br>
><br>
>     &XC<br>
>       &XC_FUNCTIONAL PBE<br>
>       &END XC_FUNCTIONAL<br>
>     &END XC<br>
><br>
>     &PRINT<br>
>      &MULLIKEN<br>
>      &END MULLIKEN<br>
><br>
>      &LOWDIN<br>
>      &END LOWDIN<br>
>     &END<br>
><br>
>   &END DFT<br>
>   &SUBSYS<br>
>     &CELL<br>
>    ABC [angstrom]   30 30 30<br>
>     &END CELL<br>
>     &TOPOLOGY<br>
>       COORD_FILE_NAME water.xyz<br>
>       COORDINATE xyz<br>
>     &END<br>
><br>
>     &KIND O<br>
>       BASIS_SET TZV2P-MOLOPT-GTH<br>
>       POTENTIAL GTH-PBE-q6<br>
>     &END KIND<br>
>     &KIND H<br>
>       BASIS_SET TZV2P-MOLOPT-GTH<br>
>       POTENTIAL GTH-PBE-q1<br>
>     &END KIND<br>
><br>
>   &END SUBSYS<br>
><br>
> &END FORCE_EVAL<br>
><br>
> &GLOBAL<br>
>   PRINT_LEVEL LOW<br>
>   PROJECT H2O<br>
>   RUN_TYPE ENERGY<br>
>   WALLTIME 285000<br>
> &END GLOBAL<br>
><br>
> &MOTION<br>
>     &GEO_OPT<br>
>      MAX_ITER 5000<br>
>      MAX_FORCE 0.00010<br>
>      OPTIMIZER BFGS<br>
>     &BFGS<br>
>     &END<br>
>   &END<br>
> &END<br>
><br>
> ------------------------------------------------<br>
>  the water.xyz file is<br>
> ----------------------------------------<br>
>        3<br>
>  water<br>
>   H         8.4351137971        5.1620318678       12.1510352783<br>
>   H         8.5534822942        3.6347695084       12.1803075532<br>
>   O         7.9011326518        4.3528437024       12.1874564118<br>
> ------------------------------------------------<br>
><br>
> Regards,<br>
> Manh<br>
<br>
--<br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
To unsubscribe from this group, send email to <a href="mailto:cp2k%2Bun...@googlegroups.com">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>
For more options, visit this group at <a href="http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en" target="_blank">http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en</a>.<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>