Hi,<br><br>With generalized reaction coordinates, the mean force has different values with the multipliers, e.g.<br>Eric Darve. Thermodynamic Integration Using Constrained and Unconstrained Dynamics. In <<Free Energy Calculations-theory and applications in chemistry and biology>>.<br>
I wonder if the calculation of the meanforce is implemented in CP2K.<br><br>thanks,<br>Liu<br><br><br><div class="gmail_quote">2010/1/26 Laino Teodoro <span dir="ltr"><<a href="mailto:teodor...@gmail.com">teodor...@gmail.com</a>></span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Dear Liu,<br>
<br>
you can do constrained MD and with the results of the MD you can do whatever you want.<br>
I wonder why you would expect a constraint section inside the free_energy section. Isn't one simply enough?<br>
<br>
regards,<br>
Teo<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
On 26 Jan 2010, at 08:34, Liu wrote:<br>
<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div><div></div><div class="h5">
Hi all,<br>
<br>
Is it possible to calculate free-energy with constrained MD in CP2K ?<br>
Didnot see the options in free energy option.<br>
<br>
thanks,<br>
Liu<br>
<br></div></div>
-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
To unsubscribe from this group, send email to cp2k+<a href="mailto:unsub...@googlegroups.com" target="_blank">unsub...@googlegroups.com</a>.<br>
For more options, visit this group at <a href="http://groups.google.com/" target="_blank">http://groups.google.com/</a>group/cp2k?hl=en.<br>
</blockquote>
<br>
-- <br>
You received this message because you are subscribed to the Google Groups "cp2k" group.<br>
To post to this group, send email to <a href="mailto:cp...@googlegroups.com" target="_blank">cp...@googlegroups.com</a>.<br>
To unsubscribe from this group, send email to <a href="mailto:cp2k%2Bun...@googlegroups.com" target="_blank">cp2k+uns...@googlegroups.com</a>.<br>
For more options, visit this group at <a href="http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en" target="_blank">http://groups.google.com/group/cp2k?hl=en</a>.<br>
<br>
</blockquote></div><br>