Apparently cp2k assigns the same covalent radius for the MM atoms.<br>I took the input file from tests/QMMM/QS/regtest-4/wat_nacl.inp and changed the print level to medium.<br>This is what I get:<br><br><font face="courier new,monospace">     MM    POINT CHARGES GENERATING THE QM/MM ELECTROSTATIC POTENTIAL<br>
<br> -------------------------------------------------------------------------<br>        MM ATOM:    3 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    0.417000CORR. RADIUS    1.511781<br>        MM ATOM:    4 RADIUS:    1.511781 CHARGE:   -0.834000CORR. RADIUS    1.511781<br>
        MM ATOM:    5 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    0.417000CORR. RADIUS    1.511781<br>        MM ATOM:    6 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    0.417000CORR. RADIUS    1.511781<br>        MM ATOM:    7 RADIUS:    1.511781 CHARGE:   -0.834000CORR. RADIUS    1.511781<br>
        MM ATOM:    8 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    0.417000CORR. RADIUS    1.511781<br>        MM ATOM:    9 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    0.417000CORR. RADIUS    1.511781<br>        MM ATOM:   10 RADIUS:    1.511781 CHARGE:    1.000000CORR. RADIUS    1.511781<br>
        MM ATOM:   11 RADIUS:    1.511781 CHARGE:   -1.000000CORR. RADIUS    1.511781<br><br></font><font face="arial,helvetica,sans-serif">Atom 3 is an oxygen, while 4 if a hydrogen. Is this related to periodic QM/MM?<br>
Thanks<br>Marius<br></font>