<div dir="ltr">I have a better understanding now. Thanks.<br>As I asked in the last post, if GHOST T and BASIS_SET NONE are  given, the atom will be a true ghost. This means POTENTIAL should be no longer needed. But the job won't get running unless POTENTIAL .... is given. How come that happens?<br>
<br>Could you please explain in a little more detail how the mapping and free energy module (ALCHEMICAL CHANGE in my case, I think) work in cp2k? Or give some references I can read. I noticed that there are some input examples in /cp2k/tests/FE directory, but I am afraid that I can't understand them.<br>
Thanks.<br><br>Jun<br><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 27, 2008 at 4:45 PM, Laino Teodoro <span dir="ltr"><<a href="mailto:teodor...@gmail.com">teodor...@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div style="">
Yes unfortunately there's a misunderstanding. <div>A GHOST atom is not what you think of.</div><div>A ghost for CP2K is an atom with no nuclear charge but with a basis set (which you can specify). This kind of GHOST atoms</div>
<div>are used mostly for BSSE: read carefully the online reference input: <a href="http://cp2k.berlios.de/input/InputReference%7E__ROOT__%7EFORCE_EVAL%7ESUBSYS%7EKIND.html#GHOST" target="_blank">http://cp2k.berlios.de/input/InputReference~__ROOT__~FORCE_EVAL~SUBSYS~KIND.html#GHOST</a></div>
<div><br></div><div>Of course you can put BASIS_SET NONE and in this case what you have is essentially NOTHING (i.e. no electrons, no basis set and no pseudo).</div><div><br></div><div>What you want to do can be done easily or using BASIS_SET NONE (and specifying it GHOST, see above) or just avoid the mapping of that atom </div>
<div>in the free energy module. Both methods (if properly done) will lead to the same numbers.</div><div><br></div><div>Teo</div><div class="Ih2E3d"><div><br><div><div>On 27 Aug 2008, at 17:37, Jun Cheng wrote:</div><br><blockquote type="cite">
<span style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;">POTENTIAL is needed? Or I misunderstand something?</span></blockquote>
</div><br></div><br></div><div class="Ih2E3d">
</div></div><br>
</blockquote></div><br></div>