Wow, I'm the first guy!<br><br>Attached are the *.ener file. I thought the input file (attached in the previous email) has already contained full information. If necessary, I'll send you the coordinates(thanks for your correction) as well. Thanks!<br>
<br>Sincerely, Yunfeng<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 24, 2008 at 4:38 PM, Teo <<a href="mailto:teodor...@gmail.com">teodor...@gmail.com</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>
Dear Yunfeng,<br>
<br>
since you deleted the "coordinations"  (?!?) we can practically do<br>
NOTHING.<br>
Anyway I suspect that your system is blowing up.. I mean.. your scf is<br>
becoming more and<br>
more difficult to converge.. probably the problems are really the<br>
coordinates (is this what you call coordinations ??)..<br>
<br>
Since you are the first in so many years to observe something like<br>
that.. please consider the idea that it could be<br>
due to your errors.<br>
Or possibly due to kind of miscompilation of the buggy winner prize<br>
PGI compiler.<br>
<br>
Can you post coordinates as well? or at least the .ener file?<br>
Thanks,<br>
Teo<br>
<div class="Ih2E3d"><br>
On Apr 25, 12:20 am, "LIANG Yunfeng" <<a href="mailto:liangy...@gmail.com">liangy...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> See attachment. I just deleted the coordinations.<br>
><br>
> Sincerely, Yunfeng<br>
><br>
</div><div><div></div><div class="Wj3C7c">> On Thu, Apr 24, 2008 at 4:13 PM, Matt W <<a href="mailto:MattWa...@gmail.com">MattWa...@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> > How much input/output information are you using?<br>
><br>
> > Matt<br>
><br>
> > On Apr 24, 11:06 pm, "LIANG Yunfeng" <<a href="mailto:liangy...@gmail.com">liangy...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> > > Dear Axel,<br>
><br>
> > > it is only a water system. For a small system(with 16 molecules), you<br>
> > will<br>
> > > only see it (the consuming time increase) after 5000 step(5ps), and<br>
> > becoming<br>
> > > apparent after 10,000 steps. For a large system(with 192 molecules), you<br>
> > can<br>
> > > see it around 500 steps. Well, nothing serious...The architecture is amd<br>
> > > machine with infiniband and pgi compiler.<br>
><br>
> > > Sincerely, Yunfeng<br>
><br>
> > > On Wed, Apr 23, 2008 at 11:20 AM, Axel <<a href="mailto:akoh...@gmail.com">akoh...@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> > > > On Apr 23, 12:00 pm, "LIANG Yunfeng" <<a href="mailto:liangy...@gmail.com">liangy...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> > > > > Dear All,<br>
><br>
> > > > > Have you everyone notice the consuming time for Quickstep is<br>
> > increasing<br>
> > > > as<br>
> > > > > the MD is propagating with the time?<br>
><br>
> > > > no. i don't see this. can you provide an<br>
> > > > input example...<br>
><br>
> > > > cheers,<br>
> > > >   axel.<br>
><br>
> > > > > I guess there will be a way to solve...<br>
><br>
> > > > > Sincerely, Yunfeng<br>
><br>
><br>
><br>
</div></div>>  192H2O-md.inp<br>
> 2KDownload<br>
<div><div></div><div class="Wj3C7c"><br>
</div></div></blockquote></div><br>