See attachment. I just deleted the coordinations. <br><br>Sincerely, Yunfeng<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 24, 2008 at 4:13 PM, Matt W <<a href="mailto:MattWa...@gmail.com">MattWa...@gmail.com</a>> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><br>
How much input/output information are you using?<br>
<font color="#888888"><br>
Matt<br>
</font><div class="Ih2E3d"><br>
On Apr 24, 11:06 pm, "LIANG Yunfeng" <<a href="mailto:liangy...@gmail.com">liangy...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Dear Axel,<br>
><br>
> it is only a water system. For a small system(with 16 molecules), you will<br>
> only see it (the consuming time increase) after 5000 step(5ps), and becoming<br>
> apparent after 10,000 steps. For a large system(with 192 molecules), you can<br>
> see it around 500 steps. Well, nothing serious...The architecture is amd<br>
> machine with infiniband and pgi compiler.<br>
><br>
> Sincerely, Yunfeng<br>
><br>
</div><div><div></div><div class="Wj3C7c">> On Wed, Apr 23, 2008 at 11:20 AM, Axel <<a href="mailto:akoh...@gmail.com">akoh...@gmail.com</a>> wrote:<br>
><br>
> > On Apr 23, 12:00 pm, "LIANG Yunfeng" <<a href="mailto:liangy...@gmail.com">liangy...@gmail.com</a>> wrote:<br>
> > > Dear All,<br>
><br>
> > > Have you everyone notice the consuming time for Quickstep is increasing<br>
> > as<br>
> > > the MD is propagating with the time?<br>
><br>
> > no. i don't see this. can you provide an<br>
> > input example...<br>
><br>
> > cheers,<br>
> >   axel.<br>
><br>
> > > I guess there will be a way to solve...<br>
><br>
> > > Sincerely, Yunfeng<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br>