Rad,<br><br>I do recall a bug in the velocity file which I caught around the Jan 07 time frame. Jan 07 is more than 1 year ago and there have been a number of bug fixes in the code since then.<br><br><div class="gmail_quote">
On Wed, Mar 12, 2008 at 11:33 AM, Teodoro Laino <<a href="mailto:teodor...@gmail.com">teodor...@gmail.com</a>> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>
Dear Rad,<br>
<br>
ATOMIC dumps in formatted output.<br>
I checked with a today snapshot and it is formatted.<br>
ATOMIC means that you don't have any flag for element and you have<br>
just a dump of all velocities without separation between one frame<br>
and the other.<br>
<br>
Moreover I checked and the velocities in this files are EXACTLY<br>
identical to the one of the restart file.<br>
If they are not please consider the possibility that you may have<br>
dumped the two files with different frequency.<br>
The unit in the velocity file are:<br>
<br>
-) XMOL : atomic units fot velocity<br>
-) ATOMIC: atomic units<br>
-) DCD: are angstrom/fs<br>
<br>
No idea why you're getting a binary file.. are you sure about it?<br>
Unfortunately going back with version is VERY high consuming for us..<br>
so I can only tell you that today (if there was a bug that was<br>
fixed in the meanwhile) ATOMIC gives the right thing and the units in<br>
that file are atomic units.<br>
<br>
Cheers<br>
Teo<br>
<div><div></div><div class="Wj3C7c"><br>
<br>
On 12 Mar 2008, at 15:27, Rad wrote:<br>
<br>
><br>
> Dear All,<br>
><br>
> I am working on a trajectory and velocities generated by Jan 2007<br>
> version of cp2k. In this run, the input was set up to print the<br>
> velocities in atomic format and the ouput velocities happened to be in<br>
> binary. Is this correct and if so could someone provide details of the<br>
> format for me to parse the velocities. Also it appears the velocties<br>
> printed in the velocities file and that are printed in restart file<br>
> are different. In restart file it is bohr or angstrom per a.u. what is<br>
> the unit in the velocities file?<br>
><br>
> Thanks<br>
> Rad<br>
><br>
> On Feb 27, 1:48 pm, Teodoro Laino <<a href="mailto:teodor...@gmail.com">teodor...@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> HiRad,<br>
>><br>
>> atomic units. Everytime/everywhere the unit is not specified assume<br>
>> it to be atomic units.<br>
>> Ciao,<br>
>> Teo<br>
>><br>
>> On 27 Feb 2008, at 18:32,Radwrote:<br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>>> Dear All,<br>
>><br>
>>> Could someone please tell me the unit of velocity printed in the<br>
>>> restart file?<br>
>><br>
>>> Thanks<br>
>><br>
>>> Rad- Hide quoted text -<br>
>><br>
>> - Show quoted text -<br>
> ><br>
<br>
<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Nichols A. Romero, Ph.D.<br>DoD User Productivity Enhancement and Technology Transfer (PET) Group<br>High Performance Technologies, Inc.<br>Reston, VA<br>443-567-8328 (C)<br>
410-278-2692 (O)